• Handlingen fokuserar återigen på lönnmördare och tempelriddare. Konflikten mellan britterna och patrioterna spelar en viss roll, men huvudpersonen Connor kommer aldrig att lägga sig i eller ta parti såvida det inte gynnar hans jakt på tempelriddarna.
• Connor har en helt annan personliget och andra perspektiv än Ezio, även om de båda kämpar för samma slutmål.
• Vi får följa Connor från det att han är barn fram till att han blir 30 år gammal.
• Red Dead Redemption släpptes ungefär när utvecklingen av AC3 började och har inspirerat utvecklarna på många sätt.
• Spelet har så kallad "safe running" vilket innebär att du aldrig trillar av ett föremål såvida du inte trycker en speciell knapp; detta ska bland annat underlätta trädhoppning.
• Till skillnad från Ezio så har Connor många av sina vapen från början.
• 80 procent av alla karaktärer i spelet är verkliga personer.
• När du utforskar världen och gör saker som andra ser så kan du bli rekommenderad att gå med i olika sällskap som leder till utmaningar och belöningar.
• Det är möjligt att bli inbjuden till ett jaktsällskap efter att ha jagat i närheten av någon från ett särskilt sällskap.
• Vilket vapen du använder för att döda ett djur avgör hur många poäng du får för det. Att döda en björn i närstrid ger exempelvis mycket poäng.
• Det är möjligt att spela brädspel.
• Spelet har ett nytt ekonomiskt system, men det involverar inte ägande av butiker eller akvedukter.
• De gamla spelen bygger på en motor som heter Anvil. AC3 bygger på en uppgraderad motor kallad Anvil Next, som bland annat ska kunna ge en ny typ av ljussättning.